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编号:13516404
基于“味性化味一网络靶点一分子对接”的藏药五味麝香丸治疗“真布”病的作用机制研究(2)
http://www.100md.com 2020年1月15日 《中国药房》 20202
     1.2.2 共同靶标筛选应用Excel 2016中的“SUMIF”“VLOOKUP”等函数,筛选五味麝香丸的有效成分和“真布”病的靶标蛋白,获取二者的共同靶标。

    1.2.3 网络构建与机制分析将“1.2.2”项下所获共同靶标导入DAVID 6.8生物信息学资源数据库(https://da—vid.ncifcrf.gov/)中进行“五味麝香丸一‘真布’病一基因”的基因本体(GO)和KEGG通路富集分析;使用Cytoscape3.7.0软件构建“五味麝香丸一‘真布’病一靶标一通路”网络,并进行可视化展示和网络拓扑学分析。网络中,节点代表化合物、靶蛋白、通路,边代表化合物一靶标一通路之间的相互关联。应用该软件中的“Network analyzer”功能,计算网络节点度值(该值反映了网络中与某节点相连边的数量),并选择网络中的核心靶标(节点度值≥11)进行分子对接[7]。

    1.3 分子对接分析

    1.3.1 数据来源将“1.2.3”项下所得核心靶标导人生物大分子空间结构(PDB)数据库(http://www.rcsb.org),并下载其“pdb”格式文件;应用ChemBi0 3D UItra 14软件对与核心靶标相关的五味麝香丸有效成分结构进行优化 ......
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