龙骨马尾杉PcHDR1基因克隆及序列分析(3)
2 结果与分析
2.1 龙骨马尾杉PcHDR1基因的克隆
通过搜索龙骨马尾杉高通量转录组数据[13]，从中发现一个转录本(contig00710)被注释为1羟基2甲基2(E)丁烯基4焦磷酸还原酶(HDR)基因。经分析，发现该转录本具有一个完整的开放阅读框(open reading frame，ORF)。根据该开放阅读框的序列设计基因的全长扩增引物(PcHDR1F和PcHDR1R)，以龙骨马尾杉全草RNA反转录得到的cDNA为模板，利用RTPCR技术扩增获得一条长为1 437 bp的序列，对所扩增基因命名为PcHDR1，GenBank登录号JQ957845。经PCR扩增所得的PcHDR1电泳检测情况见图1。
2.2 PcHDR1基因编码蛋白特性分析
2.2.1 理化性质分析 利用ExPASy Proteomics Server的在线软件Protparam对PcHDR1基因编码蛋白质的理化性质进行预测，结果显示PcHDR1的分子式为C2 358H3 722N630O737S16 ......
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2.1 龙骨马尾杉PcHDR1基因的克隆
通过搜索龙骨马尾杉高通量转录组数据[13]，从中发现一个转录本(contig00710)被注释为1羟基2甲基2(E)丁烯基4焦磷酸还原酶(HDR)基因。经分析，发现该转录本具有一个完整的开放阅读框(open reading frame，ORF)。根据该开放阅读框的序列设计基因的全长扩增引物(PcHDR1F和PcHDR1R)，以龙骨马尾杉全草RNA反转录得到的cDNA为模板，利用RTPCR技术扩增获得一条长为1 437 bp的序列，对所扩增基因命名为PcHDR1，GenBank登录号JQ957845。经PCR扩增所得的PcHDR1电泳检测情况见图1。
2.2 PcHDR1基因编码蛋白特性分析
2.2.1 理化性质分析 利用ExPASy Proteomics Server的在线软件Protparam对PcHDR1基因编码蛋白质的理化性质进行预测，结果显示PcHDR1的分子式为C2 358H3 722N630O737S16 ......
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