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编号:12980242
雷公藤贝壳杉烯酸氧化酶基因的全长cDNA克隆与表达分析(2)
http://www.100md.com 2017年1月1日 《中国中药杂志》 2017年第1期
     33TwKAO氨基酸序列的系統进化分析将TwKAO与GenBank下载的其他物种 KAO氨基酸序列进行比对分析,利用 MEGA 60软件采用相邻连接法构建系统进化树,见图3。选取15种植物(包括13种双子叶植物,1种单子叶植物,1种蕨类植物)和2种真菌的KAO氨基酸序列,从进化树中可以看出:双子叶植物、单子叶植物、蕨类植物、真菌聚成单独的分支,其中TwKAO归为双子叶植物分支。

    34TwKAO理化性质及3D结构预测使用ExPASy在线软件ProtParamtool预测TwKAO蛋白得到其相对分子质量5602 kDa,理论等电点889;带负电荷的残基(Asp+Glu)52,带正电荷的残基(Arg+Lys)60;不稳定系数3892,蛋白分类属于稳定蛋白;脂肪系数8969,该蛋白为亲水性蛋白。信号肽预测表明TwKAO为非分泌蛋白,不具有信号肽;亚细胞定位分析显示其可能位于内质网;同时跨膜域分析显示,TwKAO位于膜外,为非膜蛋白。三维同源模型见图4 ......
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